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去卷积与否:利用钙成像数据推断神经元活动

神经元与认知 2021-03-04 v1 应用统计

摘要

随着钙成像数据在神经科学研究中日益普及,分析钙轨迹数据的方法对于解决各种问题至关重要。观察到的钙轨迹或被直接分析,或被去卷积为脉冲序列以推断神经元活动。当两种方法均适用时,尚不清楚去卷积钙轨迹是否为必要步骤。在本文中,我们比较了使用钙轨迹或其去卷积脉冲序列进行三种常见分析的性能:聚类、主成分分析(PCA)和群体解码。我们的模拟及对真实数据的应用表明,估计的脉冲数据在聚类和PCA上均优于钙轨迹数据。尽管钙轨迹数据在每个时间点显示出比脉冲数据更高的可预测性,但在群体解码中,脉冲历史或累积脉冲计数与钙轨迹相当或优于钙轨迹。

关键词

引用

@article{arxiv.2103.02163,
  title  = {To Deconvolve, or Not to Deconvolve: Inferences of Neuronal Activities using Calcium Imaging Data},
  author = {Tong Shen and Gyorgy Lur and Xiangmin Xu and Zhaoxia Yu},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2103.02163},
  year   = {2021}
}