基于时变 $\ell_0$ 优化的多试次钙成像脉冲推断
应用统计
2021-03-08 v1 统计方法学
摘要
对遗传编码钙指示剂的光学成像是一种强大工具，可在长时间内同时从自由活动动物记录大量神经元的活动。然而，从钙荧光数据确定神经元发放的确切时刻并估计底层发放率仍具挑战性，尤其对于纵向研究获得的钙成像数据。我们提出一种多试次时变 惩罚方法，通过跨试次稳健整合演化神经动力学，联合检测脉冲并估计发放率。我们的仿真研究表明所提方法在脉冲检测与发放率估计上均表现良好。我们在两项研究的钙荧光轨迹数据上展示了方法的实用性：第一项研究显示两种行为间差异化的发放率函数，第二项研究显示因学习导致的跨试次演化发放率函数。
引用
@article{arxiv.2103.03818,
title = {Time-varying $\ell_0$ optimization for Spike Inference from Multi-Trial Calcium Recordings},
author = {Tong Shen and Kevin Johnston and Gyorgy Lur and Michele Guindani and Hernando Ombao and Zhaoxia Yu},
journal= {arXiv preprint arXiv:2103.03818},
year = {2021}
}