用于钙成像的空间相关时序字典学习
应用统计
2019-02-11 v1 其他统计学
摘要
钙成像已成为一种基础的神经成像技术,旨在恢复皮质区域中数百个神经元的个体活动。当前的方法(主要是矩阵分解)旨在检测视场中的神经元,然后推断相应的时间轨迹。在本文中,我们反转了建模方式,转而致力于最小化空间推断,同时专注于寻找数据中存在的时序轨迹集合。我们将问题重新构建为字典学习框架,其中字典包含时间轨迹,稀疏系数为空间映射。我们通过引入对时间轨迹的范数和相关性的约束,并纳入一个分层空间滤波模型以关联视场上时间轨迹的使用,使字典学习适应钙成像。我们在合成和真实数据上证明,我们的解决方案在初始化、隐式推断神经元数量以及同时检测不同神经元类型方面具有优势。
引用
@article{arxiv.1902.03132,
title = {Learning spatially-correlated temporal dictionaries for calcium imaging},
author = {Gal Mishne and Adam S. Charles},
journal= {arXiv preprint arXiv:1902.03132},
year = {2019}
}
备注
5 pages, 4 figures