神经元图：用于钙成像记录的微观功能神经元网络的图论入门
神经元与认知
2020-10-20 v1 定量方法
摘要
连接网络是神经生物学的基本结构。理解这些网络将有助于我们阐明计算神经机制。从数学上讲，这些网络是“图”——包含相互连接对象的结构。在神经科学中，对象可以是脑区，例如 fMRI 数据，也可以是单个神经元，例如荧光显微镜钙成像。图的正式研究即图论，可为神经科学家提供大量探索网络的算法。图论已以多种方式应用于 fMRI 数据，但近来已开始应用于神经元尺度，例如来自功能性钙成像的数据。在本入门中，我们解释图论基础并将其与钙成像得到的微观功能神经元网络的特征相联系——即神经元图。我们探讨图论应用于钙成像的近期实例，并强调新入该领域的研究者可能出错的若干方面。
引用
@article{arxiv.2010.09601,
title = {Neuronal graphs: a graph theory primer for microscopic, functional networks of neurons recorded by Calcium imaging},
author = {Carl J. Nelson and Stephen Bonner},
journal= {arXiv preprint arXiv:2010.09601},
year = {2020}
}
备注
28 pages, 11 figures, 1 table, 2 boxes