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存在重组时的固定时间

种群与进化 2010-05-04 v2 统计力学

摘要

我们研究了一个无限大小的单倍体群体在两位点模型中,以概率 rr 进行重组的进化动力学。从一个低适应度位点开始,群体在突变、选择和重组的作用下进化,直到有限比例的群体达到最适应位点。我们发展了一种解析方法,用于计算在不同上位性选择下达到最适应位点的固定时间 TT。我们发现:(1) 对于负上位性,TT 在小 rr 时缓慢减小,但在较大 rr 时快速衰减;(2) 对于正上位性,TT 在小 rr 时线性增加,在大 rr 时增加平缓;(3) 对于补偿突变,当重组比例接近临界值时,TT 以幂律形式发散并带有对数修正。我们的计算与精确数值结果吻合良好。

关键词

引用

@article{arxiv.0905.3262,
  title  = {Time to fixation in the presence of recombination},
  author = {Kavita Jain},
  journal= {arXiv preprint arXiv:0905.3262},
  year   = {2010}
}

备注

Corrected definition of linkage disequilibrium, new Section 5 added; Version to appear in Theo. Pop. Biol