补偿性替代替代路径的动力学

位点间的上位性相互作用在进化生物学中是一个核心问题，且在基因组时代日益重要。尽管补偿性替代的群体遗传学已受到相当多的关注，但大多数研究集中于自然选择对有害中间态具有极强选择压力的情形。在弱至中等选择强度这一生物学上合理的情景下，存在两条补偿性替代的替代路径。在一条路径中，有害突变在补偿性突变发生之前即被固定；在另一条路径中，两个位点同时呈现多态性。沿这两条路径的补偿性替代速率及其相对概率是种群大小、选择强度、突变率和重组率的函数。本文解析推导了这些速率和路径概率，并利用群体遗传模拟进行了验证。当选择强度中等时，这两条路径的预期持续时间相似，但在选择强度较弱时则不然。本文还利用模拟探讨了重组对替代过程动力学的影响。基于推导出的速率，提出了一种补偿性进化过程的系统发育替代模型，该模型可用于从种间数据推断群体遗传参数。