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三颗珠子旋转链模型显示蛋白质拉伸的普遍性

软凝聚态物质 2009-09-29 v4 统计力学 生物大分子

摘要

我们提出了一种蛋白质模型,包含蛋白质主链中所有关键原子,从而扩展了自由旋转链模型。我们使用来自 Protein Data Bank 的平均键长和平均角作为输入参数,将残基数作为唯一变量。该模型用于研究蛋白质在熵模式下的拉伸。我们的蒙特卡洩仿真结果与实验数据良好吻合,表明力-伸展曲线是普遍的,不取决于侧链或蛋白质的初级结构。

关键词

引用

@article{arxiv.cond-mat/0409492,
  title  = {Three Bead Rotating Chain model shows universality in the stretching of proteins},
  author = {Hamed Seyed-allaei},
  journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0409492},
  year   = {2009}
}