三颗珠子旋转链模型显示蛋白质拉伸的普遍性
软凝聚态物质
2009-09-29 v4 统计力学
生物大分子
摘要
我们提出了一种蛋白质模型,包含蛋白质主链中所有关键原子,从而扩展了自由旋转链模型。我们使用来自 Protein Data Bank 的平均键长和平均角作为输入参数,将残基数作为唯一变量。该模型用于研究蛋白质在熵模式下的拉伸。我们的蒙特卡洩仿真结果与实验数据良好吻合,表明力-伸展曲线是普遍的,不取决于侧链或蛋白质的初级结构。
引用
@article{arxiv.cond-mat/0409492,
title = {Three Bead Rotating Chain model shows universality in the stretching of proteins},
author = {Hamed Seyed-allaei},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0409492},
year = {2009}
}