具有长程相关结构无序的 DNA 环的热力学
基因组学
2007-10-25 v1 统计力学
摘要
我们研究了结构无序对受机械/拓扑约束（如环状）的二维弹性链热力学性质的影响。无序通过自发曲率引入，其沿链的分布要么无关联，要么具有长程关联 (LRC)。针对弱无序情况，数值和解析地推导了单环系统的平衡性质。研究表明，LRC 有利于小环的形成，且 LRC 越强，环尺寸越小。我们利用首次通过时间形式体系表明，在存在 LRC 的情况下，典型的短时环动力学表现为超扩散。最后讨论了其对真核染色质中核小体定位和动力学的潜在生物学意义。
引用
@article{arxiv.0710.4398,
title = {Thermodynamics of DNA loops with long-range correlated structural disorder},
author = {Cédric Vaillant and Benjamin Audit and Alain Arnéodo},
journal= {arXiv preprint arXiv:0710.4398},
year = {2007}
}