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模型球状蛋白质的低密度/高密度液相转变

统计力学 2015-03-13 v1 软凝聚态物质 生物物理

摘要

我们结合蒙特卡洛模拟和有限温度经典密度泛函理论计算,研究了分子尺寸(排除体积)和相互作用范围对模型球状蛋白质的表面张力、相图和成核性质的影响。我们使用了一种参数化势,它可以平滑地从简单流体特征的标准 Lennard-Jones 相互作用,过渡到溶液中球状蛋白质有效相互作用的 ten Wolde-Frenkel 模型。我们发现,诸如蛋白质等大分子的大排除体积特征是决定液-气表面张力和成核性质的主导因素。势作用范围的变化仅在排除体积较小(如简单流体)的情况下才显得重要。随后,DFT 计算被用于研究从低密度相到高密度相的均匀成核,包括成核势垒、成核路径和成核率。研究发现,成核势垒通常仅有几个 kBTk_{B}T,且成核率显著高于经典成核理论的预测值。

关键词

引用

@article{arxiv.1003.5731,
  title  = {The low-density/high-density liquid phase transition for model globular proteins},
  author = {Patrick Grosfils and James F. Lutsko},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1003.5731},
  year   = {2015}
}

备注

To appear in Langmuir