点突变对蛋白质能量传导路径的影响
生物大分子
2011-11-23 v1 生物物理
摘要
通过简单的弹性网络模型，鉴定了心肌兰尼碱受体 RyR2 的 173 个氨基酸 N 端结构域的能量响应残基。以相关方式响应空间相邻残基波动的残基，确定了一条贯穿该蛋白质的氢键路径。该蛋白质的进化保守残基均位于此路径或其近旁。该路径的所有残基要么位于该蛋白质的两个 MIR 结构域上，要么与它们形成氢键。基于对另一种钙通道受体——肌醇 1,4,5-三磷酸受体（IP3R）的弹性网络分析所获得的见解，两个钙结合残基 E171 和 E173 被提议为潜在的钙结合区域。对致病性 A77V 突变 RyR2 的分析表明，由于某些残基能量响应性的丧失，该路径被破坏。
引用
@article{arxiv.1111.5165,
title = {The effect of point mutations on energy conduction pathways in proteins},
author = {Nazan B. Walpoth and Burak Erman},
journal= {arXiv preprint arXiv:1111.5165},
year = {2011}
}
备注
14 pages, 8 figures, a supplementary section