拥挤效应对短 DNA 熔解的影响：与实验的比较
软凝聚态物质
2022-02-10 v1
摘要
我们研究拥挤物对同质与异质 DNA 分子熔解曲线的影响。我们求出短 DNA 分子的熔解曲线，并将我们的发现与实验进行比较。我们考虑沿链的一些拥挤物随机分布，并通过寻找与实验的最佳匹配，试图在 Ghosh \cite{Ghosh_PNAS_2020} 的实验发现中确定拥挤物的位置。我们还研究了在链中仅存在一个拥挤物时不同长度（25、50、75）同质 DNA 分子的熔解。通过将拥挤物位置从一端变到另一端，我们发现熔解温度对两端处拥挤物的位置敏感。同时，由于拥挤物位置导致的熔解温度变化极小。{\it 在活体内}，拥挤物的强度可能沿链变化。我们研究在五个不同强度拥挤物存在下长异质链的熔解。我们发现，在可变强度拥挤物存在下，DNA 的熔解过程有显著变化。
引用
@article{arxiv.2202.04510,
title = {The crowding effect on the melting of short DNA: Comparison with experiments},
author = {Neha Mathur and Amar Singh and Navin Singh},
journal= {arXiv preprint arXiv:2202.04510},
year = {2022}
}