生化相互作用的精确性由吸热逐步动力学确保
分子网络
2016-09-28 v1
摘要
生命系统的辨识行为依赖于从细胞内大量分子碰撞中筛选出的准确相互作用。为确保相互作用的可靠性，经典观点将结合伙伴设想为精细预适应的分子，基于其在一步结合中的亲和力经进化选择而来。但不恰当相互作用的反选择实际上可以通过困难的多步调整更高效获得，其最终的高能态被一个涨落棘轮所锁定。立体调整过程中分子键的逐步增加可建模为一个主要向后的随机游走，其首次到达被一个微观不可逆转变冻结。我们提出了一种基于排斥/结合比率的配体特异性新判据。除了在相互作用选择性中的作用外，这一通用法则还可以构成其他重要生物学现象的基础，例如超分子复合物的低水平规则合成、单稳态动力学双模态、底物浓度阈值或具有储能且可快速解聚的结构（如微管）的制备。
引用
@article{arxiv.1609.08310,
title = {The accuracy of biochemical interactions is ensured by endothermic stepwise kinetics},
author = {Denis Michel and Benjamin Boutin and Philippe Ruelle},
journal= {arXiv preprint arXiv:1609.08310},
year = {2016}
}
备注
14 pages, 8 figures