用双分子反应随机逼近高阶分子反应
分子网络
2021-01-05 v2 动力系统
摘要
涉及三个或更多反应物的生化反应称为高阶分子反应，在理论系统与合成生物学中具有重要作用。特别地，此类反应支撑多种重要的生物动力学现象，如多稳态/多模态、振荡、分岔及噪声诱导效应。然而，实验上仅能实现至多两个反应物的反应，即双分子反应。为弥合这一差距，本文提出一种算法，可系统性地用双分子反应逼近任意高阶分子反应，同时保持底层随机动力学。借助奇异扰动理论建立了该算法的性质与收敛性。该算法被应用于多种高阶分子生化网络，并证明在基于核酸的合成生物学中发挥重要作用。
引用
@article{arxiv.1811.02766,
title = {Stochastic approximations of higher-molecular by bi-molecular reactions},
author = {Tomislav Plesa},
journal= {arXiv preprint arXiv:1811.02766},
year = {2021}
}