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线性混合模型的纵向建模全流程教学:以小鼠体重生长为例的可复现案例研究

统计方法学 2025-11-19 v1 其他定量生物学

摘要

背景:线性混合模型是分析纵向连续数据中心方法,但许多学习者仅接触零散的公式或软件输出,缺乏完整的工作流程。亟需一个单一、可复现的案例研究,将问题、模型构建、诊断与解释串联起来。方法:我们重新分析了一项包含31只小鼠、分为3组、每只小鼠在12周内每周称重的实验。我们将数据整理为长格式,利用轮廓图阐释线性时间趋势,随后拟合三个随机截距线性混合模型:公共斜率模型、完全互作用的组间时间模型,以及保守模型(两个组共享斜率,第三个组额外斜率)。分别采用最大似然、AIC、BIC和似然比检验比较模型,并使用线性对比估计组间每周均值差异及12周增益。结果:保守模型与完全互作用模型拟合相当,但显著优于公共斜率模型,揭示两组小鼠增长相似且较小,另一组增长显著更快,且差异具有高度显著性。解释:本案例研究提供了从原始数据、探索性图表到模型选择、诊断和针对性对比的完整、可执行工作流程。通过明确将科学问题映射到模型术语和可估计对比,并提供R代码和步骤检查表,作为生物统计学、流行病学及相关领域的教学和实际应用模板。

关键词

引用

@article{arxiv.2511.14523,
  title  = {Teaching Longitudinal Linear Mixed Models End-to-End: A Reproducible Case Study in Mouse Body-Weight Growth},
  author = {Sunday A. Adetunji},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2511.14523},
  year   = {2025}
}

备注

42 pages, 5 figures, 7 tables. Includes fully reproducible R code and teaching materials for longitudinal linear mixed models using a mouse body-weight case study