最长公共子序列的期望长度、方差及分布的系统评估
离散数学
2013-06-19 v1
摘要
最长公共子序列 (LCS) 问题是数学中一个非常重要的问题,在调度问题、物理学和生物信息学中有着广泛的应用。已知对于两个给定的无限长随机序列,LCS 的期望长度将是一个常数,然而该常数的值尚未知晓。此外,LCS 长度的方差分布也未完全被理解。当存在 (a) 多个序列,(b) 字母分布不均匀的序列,以及 (c) 大字母表时,问题变得更加困难。本工作聚焦于这些更复杂的问题。基于广泛的 Monte Carlo 模拟,我们系统地分析了 LCS 的期望长度、方差和分布。关于期望长度的结果与目前证明的理论结果一致,而对方差和分布的分析为该问题提供了进一步的见解。
引用
@article{arxiv.1306.4253,
title = {Systematic assessment of the expected length, variance and distribution of Longest Common Subsequences},
author = {Kang Ning and Kwok Pui Choi},
journal= {arXiv preprint arXiv:1306.4253},
year = {2013}
}