合成基因网络的同步与聚类：顺式调控模块的作用
分子网络
2009-04-06 v1 定量方法
摘要
详细研究了通过顺式调控模块（CRM）进行信号整合对由群体感应耦合的双组分遗传振荡器种群的同步和聚类的影响。我们发现 CRM 在实现同步和聚类中起着重要作用。为此，我们研究了 6 种可能的顺式调控输入函数（CRIF），其响应类型包括 AND、OR、ANDN、ORN、XOR 和 EQU，并考虑了两种可能的细胞间通讯方式：激活子调控通讯（即自诱导物调控激活子）和阻遏子调控通讯（即自诱导物调控阻遏子）。理论分析和数值模拟均表明，不同的 CRM 驱动根本不同的细胞模式，例如完全同步、各种簇平衡态以及几种簇非平衡态。
引用
@article{arxiv.0904.0506,
title = {Synchronization and clustering of synthetic genetic networks: A role for cis-regulatory modules},
author = {Jiajun Zhang and Zhanjiang Yuan and Tianshou Zhou},
journal= {arXiv preprint arXiv:0904.0506},
year = {2009}
}
备注
30 pages, 8 figures