中文

SwiftRepertoire:基于动态核代码的少样本免疫签名合成

机器学习 2026-04-23 v4

摘要

T cell receptors 的 repertoire 级别分析为疾病检测和免疫监测提供了以生物学为导向的信号,然而实际部署受 label sparsity、cohort heterogeneity 以及适应大型编码器以新任务的计算负担的阻碍。我们提出一种框架,从学习字典中的 prototype 集合中合成紧凑的 task-specific 参数化。这些参数化依据轻量级 task descriptors 生成,这些 descriptors 源自 repertoire probes 和 pooled embedding 统计信息。这种合成产生小型 adapter 模块应用于冻结的 pretrained backbone,从而在仅少量 support examples 的情况下即可适应新任务,无需完整模型 fine-tuning。该架构通过 motif-aware probes 和校准的 motif discovery pipeline 保持可解释性,这些 pipeline 将预测决策链接到 sequence-level 信号。综上,这些组件为在 labeled data 稀缺且计算资源受限的 diverse clinical and research setting 中将 repertoire-informed 模型转化为实用、样本高效且可解释的路径提供了可能。

关键词

引用

@article{arxiv.2602.01051,
  title  = {SwiftRepertoire: Few-Shot Immune-Signature Synthesis via Dynamic Kernel Codes},
  author = {Rong Fu and Muge Qi and Yang Li and Yabin Jin and Jiekai Wu and Jiaxuan Lu and Chunlei Meng and Youjin Wang and Zeli Su and Juntao Gao and Li Bao and Qi Zhao and Wei Luo and Simon Fong},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2602.01051},
  year   = {2026}
}

备注

19 pages, 8 figures, 8 tables