亚细胞 mRNA 定位调控细菌中小 RNA 对基因表达的调节
生物物理
2017-09-13 v1
摘要
小型非编码 RNA 可在细菌中对基因表达发挥显著的调控活性。近年来，人们在理解 sRNA 调控细菌基因表达方面取得了实质性进展。然而，近期发现表明 mRNA 家族呈现出非平凡的亚细胞分布，这引出了一个问题：定位如何影响 sRNA 的调控活性。本文在一个简单的数学模型中探讨了这一问题。我们证明，mRNA 的非均匀空间分布可以改变以化学计量方式作用的 sRNA 所特有的阈值线性响应，并调节由同一 sRNA 共调控的靶标之间的层级关系。我们还确定了 sRNA 通路中辅因子的亚细胞组织可在 sRNA 靶标上诱导空间异质性的条件。我们的结果表明，在某些条件下，对天然和合成基因调控回路的解释与建模需要考虑参与基因转录本的空间组织。
引用
@article{arxiv.1703.08574,
title = {Sub-cellular mRNA localization modulates the regulation of gene expression by small RNAs in bacteria},
author = {Hamid Teimouri and Elgin Korkmazhan and Joel Stavans and Erel Levine},
journal= {arXiv preprint arXiv:1703.08574},
year = {2017}
}