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细菌转录与翻译的空间组织

亚细胞过程 2016-08-30 v3

摘要

在诸如 Escherichia coli\textit{Escherichia coli} 的细菌中,DNA 被压缩成位于细胞中心附近的拟核,而核糖体——将信使 RNA (mRNAs) 翻译成蛋白质的分子复合物——主要定位于两极。我们利用细胞转录 - 翻译机制的最小反应 - 扩散模型研究了这种空间组织的影响。我们的模型预测约 90%\sim 90\% 的 mRNAs 被隔离到两极,并揭示了一种由 mRNAs 通量驱动的核糖体“循环”,即从拟核中的合成到两极的降解。为了解决核糖体与 mRNAs 之间非特异性瞬时相互作用的存在性问题,我们开发了一种新方法,能够有效地将此类瞬时相互作用纳入反应 - 扩散方程,从而使我们能够量化此类非特异性相互作用的生物学意义,例如对核糖体效率的影响。

关键词

引用

@article{arxiv.1503.03928,
  title  = {Spatial organization of bacterial transcription and translation},
  author = {Michele Castellana and Sophia Hsin-Jung Li and Ned S. Wingreen},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1503.03928},
  year   = {2016}
}