肌球蛋白马达结构域的结构变化与核苷酸解离
生物大分子
2007-05-23 v2
摘要
我们利用粗粒化蛋白模型的分子动力学模拟,研究了肌球蛋白马达结构域从前运力冲程态到近 rigor 态的结构弛豫。为描述该结构变化,我们提出“双重 Go 模型”,一种具有两个参考结构的类 Go 模型变体。通过在模拟中引入粗粒化核苷酸,亦研究了核苷酸解离过程。我们发现,在核苷酸解离之前,肌球蛋白向近 rigor 构象的结构弛豫无法完成。此外,当核苷酸紧密结合于肌球蛋白头部时,弛豫与解离协同发生。结果表明核苷酸的主要作用在于抑制结构弛豫。
引用
@article{arxiv.q-bio/0605031,
title = {Structural Change of Myosin Motor Domain and Nucleotide Dissociation},
author = {Fumiko Takagi and Macoto Kikuchi},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0605031},
year = {2007}
}