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非持续性分子马达小系综的随机动力学:平行簇模型

生物物理 2015-06-16 v2 亚细胞过程

摘要

非持续性分子马达必须在系综中协同工作才能产生可观的力或运动。例如,在骨骼肌中,数百个肌球蛋白 II 分子在粗丝中协同作用。相比之下,在非肌肉细胞中,由几十个非肌肉肌球蛋白 II 马达组成的小群体有助于运输、形状变化或机械传感等基本细胞过程。在此,我们针对这一重要情况引入了一种详细且解析可处理的模型。利用肌球蛋白 II 马达循环的三态横桥模型,并利用快速动力冲程动力学和等效状态下马达间负载均分的假设,我们将随机反应网络简化为用于结合和解离动力学的单步主方程(平行簇模型),并推导了系综运动的规则。我们发现,对于恒定外部负载,系综动力学深受肌球蛋白 II 的捕捉键 (catch bond) 特性影响,这导致负载下结合马达的比例增加,从而使即使是小系综也能牢固附着。这种对负载的适应性产生了一种由 Hill 关系描述的凹形力 - 速度关系。对于由线性弹簧提供的外部负载,肌球蛋白 II 系综会动态调整自身趋向于具有恒定平均位置和负载的等长状态。此时,系综的动力学主要由马达在不同种类结合态上的分布决定。随着外部弹簧刚度的增加,存在一个急剧的转变,超过该转变点后肌球蛋白 II 将无法执行动力冲程。从前动力冲程态的缓慢解离保护了系综免于脱离。

关键词

引用

@article{arxiv.1307.6510,
  title  = {Stochastic dynamics of small ensembles of non-processive molecular motors: the parallel cluster model},
  author = {Thorsten Erdmann and Philipp J. Albert and Ulrich S. Schwarz},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1307.6510},
  year   = {2015}
}

备注

Revised version accepted for publication at Journal of Chemical Physics. Supplementary text included as appendix. [revtex, 72 pages, 35 figures]