从计算视角看核碱基的激发 II：动力学
化学物理
2017-03-29 v1
摘要
本章致力于从时间依赖的视角揭示气相中孤立 DNA/RNA 核碱基光激发后发生的弛豫过程。为此，有几种方法可供使用，从全量子动力学到各种半经典或从头算分子动力学，各有其优势与局限性。正如本贡献所示，迄今为止用于研究气相核碱基失活的最常见方法是将 Tully 表面跳跃算法与即时 CASSCF 计算相结合。不同的方法，甚至更显著地，不同的电子结构方法可能提供不同的动力学。本文对每种核碱基建议的不同机制进行了全面综述，并与可用的实验时间尺度进行了比较。在涉及不同应用的电子结构和动力学方法效应的一般背景下讨论了结果。阐明了两组核碱基——嘌呤衍生物（腺嘌呤和鸟嘌呤）与嘧啶衍生物（胸腺嘧啶、尿嘧啶和胞嘧啶）——之间的机制相似性与差异。最后，给出了在核碱基弛豫背景下动力学模拟的未来展望。
引用
@article{arxiv.1703.09483,
title = {Excitation of Nucleobases from a Computational Perspective II: Dynamics},
author = {Sebastian Mai and Martin Richter and Philipp Marquetand and Leticia González},
journal= {arXiv preprint arXiv:1703.09483},
year = {2017}
}
备注
54 pages, 19 figures