连接组蛋白H1与DNA结合的结构与动力学性质
生物物理
2010-08-12 v1 生物大分子
摘要
连接组蛋白H1存在于所有真核细胞中，已知其与核小体连接DNA结合并重新排列。在体外，H1/DNA相互作用的基本性质引起了研究界的广泛兴趣——对于生物学家而言，是从染色质组织解读的角度；对于物理学家而言，是从聚电解质相互作用研究的角度。因此，H1/DNA结合过程以及这些自组装体的结构和动力学信息具有广泛的重要性。为了定量理解H1诱导的DNA压缩机制，我们的策略基于结合微流控技术使用小角X射线微衍射。微流控流体动力聚焦装置的使用有助于对这些自组装过程进行微尺度控制。此外，该方法能够实现原位结构形成的时间分辨观测，特别是瞬态中间态。观察到的时间相关结构演化表明，H1与DNA的相互作用可以描述为两步过程：H1与DNA的初始非特异性结合，随后是分子在形成的组装体内的重排。第二步很可能是由蛋白质带电侧链与DNA之间的相互作用诱导的。这导致DNA/蛋白质组装体内的晶格间距增加，并引起中间相相关长度的减小，这可能是由于DNA的局部弯曲所致。
引用
@article{arxiv.1008.1955,
title = {Structural and dynamic properties of linker histone H1 binding to DNA},
author = {Rolf Dootz and Adriana Cristina Toma and Thomas Pfohl},
journal= {arXiv preprint arXiv:1008.1955},
year = {2010}
}
备注
21 pages, 6 figures