分布式基因广播系统中的随机共振：NF$\kappa$B/I$\kappa$B 范式
分子网络
2019-03-11 v1
摘要
基因调控网络必须以高效、及时且连贯的方式将信息从细胞外信号传递给下游基因。许多复杂的功能任务（如免疫反应）需要将信息系统性地广播给不止一个，而是许多执行不同功能的基因，这些基因的动态结合与解离特性广泛分布。在这样的广播网络中，预期的目标位点在数量上也常常被更为众多的非功能性结合位点所掩盖。以 NFB 基因调控网络为例系统，我们探索了拥有众多分布式位点对振荡广播基因网络随机动力学的影响，指出了结合循环中的共振如何控制网络的特异性和性能。我们还表明，通过 DNA 结合转录因子的分子剥离来对结合与解离进行主动动力学调节，可以导致更高的基因共表达连贯性和同步清除。
关键词
引用
@article{arxiv.1903.03231,
title = {Stochastic resonances in a distributed genetic broadcasting system: the NF\k{appa}B/I\k{appa}B paradigm},
author = {Zhipeng Wang and Davit A Potoyan and Peter G Wolynes},
journal= {arXiv preprint arXiv:1903.03231},
year = {2019}
}
备注
13 pages, 4 figures