SOFI:将原子簇中点群对称性的寻找视为形状匹配问题中的简并解集寻找
计算物理
2024-08-14 v2 化学物理
摘要
点群(PG)对称性在理论化学和计算材料科学的许多方面扮演着基础性角色。为了自动化通用原子簇的 PG 对称操作搜索,我们提出了一种新算法——对称操作查找器(SOFI)。SOFI 通过将 PG 对称性识别问题框定为形状匹配中的简并解问题来解决该问题,其中多个解对应不同的对称操作。将开发的算法与另外三种专门用于 PG 识别的算法在一大批原子簇上进行了对比。结果连同一些说明性用例展示了 SOFI 的有效性。SOFI 算法作为 IRA 库的一部分发布,可访问 https://github.com/mammasmias/IterativeRotationsAssignments。
引用
@article{arxiv.2408.06131,
title = {SOFI: Finding point group symmetries in atomic clusters as finding the set of degenerate solutions in a shape-matching problem},
author = {Miha Gunde and Nicolas Salles and Luca Grisanti and Layla Martin-Samos and Anne Hemeryck},
journal= {arXiv preprint arXiv:2408.06131},
year = {2024}
}