DNA适配体的断裂：来自模拟的新见解
软凝聚态物质
2015-11-23 v1 生物物理
生物大分子
摘要
双链DNA中的碱基袋（非互补碱基对）在生物过程中起着关键作用。由于热涨落，它会降低DNA的稳定性，而在DNA适配体的情况下，小分子如腺苷酸单磷酸(AMP)、腺苷三磷酸(ATP)等与碱基袋形成称为“结合袋”的额外氢键，从而增强稳定性。利用DNA粗粒化模型的朗之万动力学模拟以及随后的全原子模拟，我们研究了碱基袋和结合袋对DNA适配体稳定性的影响。本文报道了由温度和力诱导的分离之间的显著差异，这需要单分子实验的进一步研究。
引用
@article{arxiv.1511.00127,
title = {Rupture of DNA Aptamer: new insights from simulations},
author = {Rakesh Kumar Mishra and Shesh Nath and Sanjay Kumar},
journal= {arXiv preprint arXiv:1511.00127},
year = {2015}
}
备注
15 pages, 5 figures