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盐浓度对异质DNA稳定性的影响

软凝聚态物质 2015-09-29 v1

摘要

我们研究了阳离子对双链DNA(dsDNA)分子稳定性的作用。已知双链DNA(dsDNA)的两条链因磷酸基团而带有负电荷。溶液中以盐形式存在的阳离子作为屏蔽剂,从而减小这些链之间的排斥。我们研究了几种异质DNA分子。利用Peyrard-Bishop-Dauxois(PBD)模型,我们计算了热力学系综与力系综下DNA分子的相图。解离能与堆积能是影响DNA稳定性的两个最重要因素。通过对模型参数进行适当修改,我们研究了阳离子浓度对不同异质DNA分子稳定性的作用。本工作的目标是理解这些阳离子如何改变链上不同碱基对或碱基的强度。力系综情形(从一端拉伸dsDNA)的相图与实验结果进行了比较。

关键词

引用

@article{arxiv.1509.08191,
  title  = {Effect of salt concentration on the stability of heterogeneous DNA},
  author = {Amar Singh and Navin Singh},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1509.08191},
  year   = {2015}
}