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B-DNA单体与二聚体中空穴振荡的RT-TDDFT研究

生物物理 2018-02-26 v1 化学物理

摘要

我们采用实时含时密度泛函理论研究了B-DNA单体(一个碱基对)或二聚体(两个碱基对)内的空穴振荡。最初将空穴置于构成碱基对的任一碱基上,会产生THz振荡,尽管振幅可忽略。最初将空穴置于构成二聚体的任一碱基对上则更有趣:对于由相同单体构成的二聚体,我们预测频率在 ff \approx 20-80 THz范围内的振荡,最大转移百分比接近1。对于由不同单体构成的二聚体,ff \approx 80-400 THz,但最大转移百分比非常小或较小。我们将我们的结果与最近通过紧束缚方法获得的结果比较,发现它们吻合良好。

关键词

引用

@article{arxiv.1704.07413,
  title  = {RT-TDDFT study of hole oscillations in B-DNA monomers and dimers},
  author = {M. Tassi and A. Morphis and K. Lambropoulos and C. Simserides},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1704.07413},
  year   = {2018}
}