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分子性质景观的粗糙度及其对可建模性的影响

定量方法 2022-10-13 v1

摘要

在分子发现和药物设计中,结构-性质关系和活性景观常被定性或定量分析以指导化学空间的导航。这些分子性质景观的粗糙度(或平滑度)是其被研究最多的几何属性之一,因为它可以表征活性悬崖的存在,通常预期较粗糙的景观会带来更难的优化挑战。在此,我们引入一种描述分子性质景观粗糙度的通用定量度量。所提出的粗糙度指数(ROGI)松散地受分形维数概念的启发,并与机器学习模型在众多回归任务上实现的样本外误差强相关。

关键词

引用

@article{arxiv.2207.09250,
  title  = {Roughness of molecular property landscapes and its impact on modellability},
  author = {Matteo Aldeghi and David E. Graff and Nathan Frey and Joseph A. Morrone and Edward O. Pyzer-Knapp and Kirk E. Jordan and Connor W. Coley},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2207.09250},
  year   = {2022}
}

备注

17 pages, 6 figures, 2 tables (SI with 17 pages, 16 figures)