自环在芽殖酵母细胞周期网络中的作用
分子网络
2018-11-21 v2 无序系统与神经网络
摘要
网络动力学研究在生物与社会科学中是非常活跃的领域。然而，网络结构与其动力学吸引子之间的关系尚未被充分理解。本研究利用芽殖酵母细胞周期网络模型，数值考察了退化自环对吸引子及其 basin 大小的作用。该网络中，所有自环均负向抑制节点（自抑制环），且吸引子仅为不动点，即点吸引子。我们发现，当吸引子仅由点吸引子组成时，移除自环对状态空间存在一种简单的划分规则。具有最大 basin 的点吸引子对自抑制环的变化是鲁棒的。此外，当向原网络添加自激活环时，会出现一些周期为 2 的极限环作为新吸引子。研究还表明，即便在此情况下，具有最大 basin 的点吸引子仍是鲁棒的。
引用
@article{arxiv.1811.03162,
title = {Role of self-loop in cell-cycle network of budding yeast},
author = {Shu-ichi Kinoshita and Hiroaki S. Yamada},
journal= {arXiv preprint arXiv:1811.03162},
year = {2018}
}
备注
6 pages, 5 figures