Ripeline 与 Rmanual 加速生物学研究与报告编写
定量方法
2020-02-06 v1 种群与进化
摘要
R 作为一种免费可用的数据分析环境，为任何科学领域的研究者带来了一套协调良好、功能强大且低成本的工具。在植物学和动物学中，这些工具可用于加速两个相距甚远但相关的领域的工作：DNA 标记分析与自然史手册编写。这两项任务都需要大量单调工作，可通过软件实现自动化。我开发了“Ripeline”和“Rmanual”两个高度可定制的基于 R 的应用，以简洁、可重复性和高效性为目标。Ripeline 是一条流水线，可实现对多个 DNA 标记的持续更新分析。Rmanual 是一本“活书”，可创建并持续更新手册与核查表。与更传统的 DNA 标记分析和手册编写方式相比，Ripeline 和 Rmanual 大幅减少了通常用于重复任务的时间，还提供了可用于广泛进一步应用的工具。
引用
@article{arxiv.2002.01475,
title = {Ripeline and Rmanual speed up biological research and reporting},
author = {Alexey Shipunov},
journal= {arXiv preprint arXiv:2002.01475},
year = {2020}
}
备注
3 figures