增强生物医学研究严谨性与可重复性的建议
其他定量生物学
2020-07-28 v5
摘要
计算方法已重塑现代生物学的格局。尽管生物医学界日益依赖计算工具，但确保开放数据、开放软件与可重复性的机制在学术机构、资助者与出版商处执行程度不一。出版物可能呈现其必要材料（如源代码与文档）不可用或变得不可用的学术软件。缺乏此类信息的出版物损害了同行评审在评估技术实力与科学贡献方面的作用。学术软件包不完整的辅助信息可能使随后用该工具产生的任何工作产生偏倚或受限。我们跨四个不同领域提供八项建议，以改善计算生物学中的可重复性、透明性与严谨性——恰是关于生命科学课程中应强调的主要价值。我们关于改进软件可用性、易用性与归档稳定性的建议旨在促进生物医学与生命科学研究中可持续的数据科学生态系统。
引用
@article{arxiv.2001.05127,
title = {Recommendations to enhance rigor and reproducibility in biomedical research},
author = {Jaqueline J. Brito and Jun Li and Jason H. Moore and Casey S. Greene and Nicole A. Nogoy and Lana X. Garmire and Serghei Mangul},
journal= {arXiv preprint arXiv:2001.05127},
year = {2020}
}