定量测定实验：癌细胞治疗中变异性建模研究
定量方法
2022-07-19 v1 动力系统
细胞行为
摘要
抑制信号通路关乎控制癌细胞存活、分裂与死亡的细胞过程。为考察所测药物的分子结构是否具有期望的抑制特性而建立的测定协议，常在不同实验中表现出巨大变异性，而在进行推断时降低此种变异性的影响至关重要。本文中我们提议透过描绘抑制机制与激活-抑制动力学的数学模型来研究实验数据。该方法通过源于黑色素瘤细胞 CXCL12/CXCR4 激活轴抑制研究所得的测定数据予以示例。为缓解数据在细胞存活测量上的变异性影响，细胞存活在理论上被构造为依赖于若干参数的时间函数。这些参数值由实验数据估计得出。以理论预定形式推导细胞存活的近似具有如下优势：(i) 对数据变异性较不敏感；(ii) 参数的估计值可直接在生物过程中解释；(iii) 该近似所解释的变异性量验证了模型质量；(iv) 数据整合入模型后可对整体过程推导更完整的视图。这些优势在所列方法的逐步实施中得到展示。
引用
@article{arxiv.2207.08449,
title = {Quantifying assays: A Modeling tale of variability in cancer therapeutics assessed on cancer cells},
author = {Roumen Anguelov and G Manjunath and Avulundiah E Phiri and Trevor T Nyakudya and Priyesh Bipath and June C Serem and Yvette N Hlophe},
journal= {arXiv preprint arXiv:2207.08449},
year = {2022}
}