Tat 系统计算模型中无特定质量控制的蛋白质易位

双精氨酸易位（Tat）系统将各种大小的折叠蛋白质转运穿过细菌和植物类囊体膜。膜结合蛋白 TatA 是 Tat 易位子的重要组成部分，在细菌膜中观察到不同大小的 TatA 簇呈广泛分布。我们假设 TatA 簇的尺寸动力学受底物结合、解离以及向相关 TatBC 簇易位的影响，其中结合有易位底物的簇倾向于生长，而未结合底物的簇倾向于收缩。通过底物结合和簇动力学的随机模型，我们数值确定了 TatA 簇的尺寸分布。我们包含了一部分被靶向但不可易位（NT）的底物，并基于简化假设：底物的可易位性不直接影响簇动力学速率常数或底物结合/解离速率。这相当于一个没有特定质量控制的易位模型。尽管如此，NT 底物仍会与 TatA 簇保持结合直至解离，因此会影响簇尺寸和易位速率。我们发现较大 TatA 簇的数量取决于 NT 组分比例$f$。易位速率可以通过调节自发底物解离速率$\Gamma_U$来优化。我们提出了一个解析可解的底物易位三态模型，该模型不包含簇尺寸动力学，但遵循我们计算的易位速率，并且与存在 NT 底物时的{\em in vitro} Tat 易位数据一致。