基于通量的机制能否解释三维细胞几何中蛋白簇的定位？
亚细胞过程
2019-09-04 v1 生物物理
摘要
细菌细胞分裂平面必须被精确放置。在黄色黏球菌（Myxococcus xanthus）中，蛋白PomX与PomY形成一个大簇，该簇由ATP酶PomZ拴系在类核上，并以随机但有偏的方式向细胞中部移动，并在此处启动细胞分裂。此前，提出了一种基于类核上PomZ通量的定位机制。然而，该簇动力学是在简化的二维几何中分析的。在此，我们引入一个数学模考虑类核三维形状，使得结合在类核上的PomZ二聚体可在不与簇相互作用的情况下扩散绕过该簇。利用随机模拟，我们发现该簇仍会移动并定位于细胞中部。胞质中PomZ经扩散的重新分布对此簇动力学至关重要。我们的机制也能将两簇等距定位于类核上。我们得出结论：基于通量的机制能够在生物学真实的三维细胞几何中实现簇的定位。
引用
@article{arxiv.1812.05780,
title = {Can a flux-based mechanism explain positioning of protein clusters in a three-dimensional cell geometry?},
author = {Matthias Kober and Silke Bergeler and Erwin Frey},
journal= {arXiv preprint arXiv:1812.05780},
year = {2019}
}
备注
9 pages, 4 figures, 10 pages of supplemental information (including 4 figures and 1 table)