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压缩DNA序列比较的隐私增强方法

密码学与安全 2011-07-20 v1 数据结构与算法

摘要

本文研究了在不同查询场景下提高压缩DNA序列比较计算效率和隐私性的方法。例如,一种场景涉及查询者Bob,他想测试自己的DNA字符串QQ是否与数据所有者Alice拥有的DNA字符串YY接近,但Bob不希望向Alice透露QQ,而Alice仅当YYQQ接近时才愿意向Bob透露YY。我们描述了一种用于比较两个压缩DNA序列的隐私增强方法,可用于实现此类场景的目标。我们的方法归结为集合差集问题,并描述了一种用于集合差集的隐私增强协议,该协议为Bob实现了绝对隐私(在信息论意义上),并为Alice提供了可量化的隐私保护程度。我们协议的一个重要特点是,其通信复杂度与感兴趣集合差集基数的阈值成正比,而非与所涉及集合的基数(与DNA序列长度相关)成正比,这使得它们非常适合隐私增强的DNA序列比较问题。此外,在我们的协议中,查询者Bob仅当集合差集的基数接近或低于指定阈值时,才能轻松计算该差集。

关键词

引用

@article{arxiv.1107.3593,
  title  = {Privacy-Enhanced Methods for Comparing Compressed DNA Sequences},
  author = {David Eppstein and Michael T. Goodrich and Pierre Baldi},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1107.3593},
  year   = {2011}
}

备注

17 pages, 2 figures