私有 DNA 测序:在离散噪声中隐藏信息
信息论
2024-11-05 v2 密码学与安全
math.IT
摘要
当个体的 DNA 被测序时,敏感的医疗信息会暴露给测序实验室。近期提出的一种隐藏个体遗传信息的方法是将其他个体的 DNA 样本混合其中。我们假设这些样本的遗传内容对个体已知、对测序实验室未知。因此,这些 DNA 样本对测序实验室而言充当“噪声”,但仍允许个体事后恢复其自身 DNA 样本。受此想法启发,我们研究利用混合 DNA 样本所提供的加性噪声隐藏二值随机变量 (遗传标记)的问题,以互信息作为隐私度量。这等价于在一组可行离散分布中,寻找从含噪观测恢复 的最坏情况噪声分布问题。我们刻画了该问题解的上下界,经验表明二者非常接近。下界通过对原离散优化问题的凸松弛获得,并给出闭式表达式。上界通过用于选择混合比例的贪心算法计算。
引用
@article{arxiv.2101.12124,
title = {Private DNA Sequencing: Hiding Information in Discrete Noise},
author = {Kayvon Mazooji and Roy Dong and Ilan Shomorony},
journal= {arXiv preprint arXiv:2101.12124},
year = {2024}
}
备注
22 pages, 7 figures, shorter version appeared in proceedings of the 2020 IEEE Information Theory Workshop (ITW), new results and explanations added in updated arXiv document