灵长类特异逆转录转座子 SVA 在改变脑功能的网络进化中的作用
神经元与认知
2016-03-01 v2 基因组学
分子网络
种群与进化
摘要
被称为 SINE VNTR Alu (SVA) 的人科特异非 LTR 逆转录转座子是人类基因组中最年轻的转座元件。最古老的 SVA A 型传播发生于约一千三百万年前，最年轻的 SVA 类型在黑猩猩分化后出现在人类基因组中。与 SVA 插入相关基因的功能富集分析表明，它们与归因于脑功能及疾病的多个本体类别强相关。在人猿类生活史不同阶段于人类基因组中扩大存在的 SVA 类型，也与逐步进化出的行为特征相关，这表明 SVA 传播对现代人类认知能力有潜在影响。SVA 相关基因在功能网络中高度互联，暗示了由 SVA 插入潜在引起的功能改变的累积影响。我们的分析揭示了 SVA 在人类中枢神经系统进化中的潜在作用，尤其是与社会和亲代行为相关的功能趋势的出现。它还支持了基于 SVA 插入可能改变的基因表达模式和基因通路，部分解释脑功能如何受免疫系统和生殖系统调控的模型。
引用
@article{arxiv.1602.07642,
title = {Primate specific retrotransposons, SVAs, in the evolution of networks that alter brain function},
author = {Olga Vasieva and Sultan Cetiner and Abigail Savage and Gerald G. Schumann and Vivien J Bubb and John P Quinn},
journal= {arXiv preprint arXiv:1602.07642},
year = {2016}
}
备注
Main body: 22 pages, 5 figures, 2 tables, pages 22-48- Supplemmentary material (5 tables)