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带电无序蛋白的相分离与单链紧致性强烈相关

生物大分子 2022-01-11 v4

摘要

内在无序蛋白(IDPs)的液-液相分离是细胞内无膜细胞器受调节形成的主要支撑因素。IDP的相行为对其氨基酸序列敏感。本文应用最近的随机相近似聚合物理论,研究蛋白质多链相分离倾向(以临界温度TcrT^*_{\rm cr}表征)如何与蛋白质的单链平均回转半径Rg\langle R_{\rm g} \rangle相关。对于一组包含等量正负电荷残基不同排列的序列,我们发现显著关联TcrRgγT^*_{\rm cr}\sim \langle R_{\rm g} \rangle^{-\gamma},其中γ\gamma大至6.0\sim 6.0,表明静电效应对促进单链构象紧致性和相分离具有类似显著影响。此外,TcrSCDT^*_{\rm cr}\propto -{\rm SCD},其中SCD是最近提出的仅由序列信息决定的“序列电荷修饰”参数。讨论了我们的发现对解读IDP相分离的序列依赖性的意义。

关键词

引用

@article{arxiv.1703.02725,
  title  = {Phase separation and single-chain compactness of charged disordered proteins are strongly correlated},
  author = {Yi-Hsuan Lin and Hue Sun Chan},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1703.02725},
  year   = {2022}
}

备注

4 page, 3 figures, accepted for publication in Biophysical Journal as a Letter