带电无序蛋白的相分离与单链紧致性强烈相关
生物大分子
2022-01-11 v4
摘要
内在无序蛋白(IDPs)的液-液相分离是细胞内无膜细胞器受调节形成的主要支撑因素。IDP的相行为对其氨基酸序列敏感。本文应用最近的随机相近似聚合物理论,研究蛋白质多链相分离倾向(以临界温度表征)如何与蛋白质的单链平均回转半径相关。对于一组包含等量正负电荷残基不同排列的序列,我们发现显著关联,其中大至,表明静电效应对促进单链构象紧致性和相分离具有类似显著影响。此外,,其中SCD是最近提出的仅由序列信息决定的“序列电荷修饰”参数。讨论了我们的发现对解读IDP相分离的序列依赖性的意义。
引用
@article{arxiv.1703.02725,
title = {Phase separation and single-chain compactness of charged disordered proteins are strongly correlated},
author = {Yi-Hsuan Lin and Hue Sun Chan},
journal= {arXiv preprint arXiv:1703.02725},
year = {2022}
}
备注
4 page, 3 figures, accepted for publication in Biophysical Journal as a Letter