序列局部与非局部电荷模式对多元致乱蛋白质素相分离及构象尺度的差异效应

intrinsically disordered proteins（IDPs）的构象特性由序列-ensemble 关系决定。为区分序列局部特征与序列非局部特征对IDP构象尺度及其相分离倾向的影响，本文比较了基于序列块状（blockiness）参数 $\kappa$ 与基于非局部性加权的序列电荷装饰（SCD）参数在多元致乱蛋白质素模型中的相关性。具体包括：通过随机相近似、场论仿真和粗粒度分子动力学模拟，对比了 $\kappa$ 与 SCD 参数与孤立链半径 $R_{\rm g}$ 以及上临界溶解温度（UCST）的相关性。结果表明，SCD 在预测 $R_{\rm g}$ 方面优于 $\kappa$，因为SCD 考虑了接触顺序（即非局部性）对孤立链构象尺度的影响。相比之下，$\kappa$ 和 SCD 在预测 UCST 方面相当不错，尽管为非理想预测器，因为在多链浓缩相中接触频率对序列位置的敏感性较低，这一点体现在 $\kappa$ 较SCD 更能关联浓缩相相互作用能。