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穿越涨落几何瓶颈的通道:开口亚扩散动力学——精确解

软凝聚态物质 2019-06-18 v2 统计力学

摘要

凝聚态介质中反应速率的通常 Kramers 理论预言速率具有 η1\eta^{-1} 依赖关系,η\eta 为介质黏度。然而早前进行的配体结合蛋白质实验显示速率具有 ην\eta^{-\nu} 依赖关系,ν\nu0.40.80.4-0.8 范围。Zwanzig (Journal of Chemical Physics 97, 3587 (1992)) 提出一个模型,其中配体须穿越涨落开口才能结合。该涨落门模型预言速率正比于 η1/2\eta^{-1/2}。Xie 等人 (Physical Review Letters 93, 1 (2004)) 的实验表明蛋白质中两组团间距离经历亚扩散。因此本文提出并求解了 Zwanzig 模型的推广,即穿越经历亚扩散的门的通道。我们的解显示速率正比于 ην\eta^{-\nu}ν\nu0.510.5-1 范围,故该模型可解释实验观测。

关键词

引用

@article{arxiv.1902.09082,
  title  = {Passage through fluctuating geometrical bottlenecks. Subdiffusive dynamics of the opening -- exact solution},
  author = {K L Sebastian},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1902.09082},
  year   = {2019}
}