利用 SAS 从血液样本中进行泛癌表观遗传生物标志物筛选
基因组学
2018-12-24 v1 统计方法学
摘要
当前癌症研究的一个关键焦点是发现能够以高准确度、低成本为患者和医院实现更早期检测的癌症生物标志物。血液样本长期以来被用作健康状况指标,但血液中的 DNA 甲基化特征在癌症研究中尚未得到充分重视。历史上,癌症分析直接针对患者的肿瘤或相关组织进行。此类分析使医生能够诊断患者的健康和癌症状况;然而,医生必须观察到某些症状才会使用活检或影像来确认诊断。这是一种事后方法。我们的研究将聚焦于用于癌症检测的表观遗传信息,特别是癌症不一致单卵双胞胎对中人外周血样本中的 DNA 甲基化信息。该信息或能帮助我们远在首发症状出现之前检测癌症。其他几类表观遗传数据也可使用,但在此我们利用 SAS 9.3 和 SAS EM 展示血液 DNA 甲基化数据作为泛癌生物标志物的潜力。我们报告,血液中可测量的 55 个甲基化 CpG 位点可用作癌症早期检测与分类的生物标志物。
引用
@article{arxiv.1812.09203,
title = {Pan-Cancer Epigenetic Biomarker Selection from Blood Samples Using SAS},
author = {Xi Chen and Jin Xie and Qingcong Yuan},
journal= {arXiv preprint arXiv:1812.09203},
year = {2018}
}
备注
9 pages, MWSUG 2018