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p进扩散过程中的振荡及蛋白质构象动力学的模拟

生物大分子 2023-06-02 v1 统计力学

摘要

在各类复杂层级系统的行为中,叠加在幂律趋势上的对数振荡会出现。本文研究用于描述蛋白质构象动力学的p进扩散模型中弛豫曲线的对数振荡。我们考虑纯p进扩散以及带有反应汇的p进扩散两种情况。我们证明,这两种情况下大时间处的弛豫曲线由幂律描述,其上叠加有对数振荡,其周期与振幅由模型参数决定。我们还给出了弛豫曲线中出现振荡的物理解释,并讨论了该结果与蛋白质弛豫动力学实验的关系。

关键词

引用

@article{arxiv.2306.00706,
  title  = {Oscillations in p-adic diffusion processes and simulation of the conformational dynamics of protein},
  author = {A. Kh. Bikulov and A. P. Zubarev},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2306.00706},
  year   = {2023}
}

备注

23 pages, 5 figures