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酵母细胞周期动力学与聚类的ODE、RDE和SDE模型

动力系统 2011-12-02 v3 细胞行为

摘要

生物学家长期观察到,在特定条件下,酵母种群中会出现类似周期性的耗氧振荡,且对此现象已有几种不尽如人意的解释。这些“自主振荡”的周期通常接近培养物计算倍增时间的整数约数。我们假设这些振荡可能由一种称为聚类的细胞周期弱同步形式引起。我们开发了一些新颖的细胞周期常微分方程模型。针对这些模型以及随机和随机扰动,我们给出了严格证明和模拟,表明细胞周期内的正负增长率反馈都是可能导致种群在细胞周期内聚类的因素。该现象出现在多种模型和广泛的参数选择中。这些结果表明聚类现象是稳健的,并且很可能在自然界中被观察到。由于聚类数量必然为整数,聚类将导致周期接近细胞周期整数约数的类周期行为。

关键词

引用

@article{arxiv.0808.0723,
  title  = {ODE, RDE and SDE Models of Cell Cycle Dynamics and Clustering in Yeast},
  author = {Erik M. Boczko and Tomas Gedeon and Chris C. Stowers and Todd Young},
  journal= {arXiv preprint arXiv:0808.0723},
  year   = {2011}
}

备注

20 pages, 9 figures. Revised version. Some material rearranged and edited