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体-面波钉扎模型的数值研究

生物物理 2022-11-01 v1

摘要

体-面波钉扎模型是用于研究细胞极化的反应扩散系统。它由表面反应扩散方程与带非线性边界条件的体扩散方程耦合构成。细胞极化随表面组分发展出特定图样而出现。由于蛋白质在细胞内部比在膜上扩散快得多,文献中常假设体组分空间均匀。因此,模型可约化为单一表面方程。然而,在实际应用中,空间非均匀体组分可能是需考虑的重要因素。本文通过数值计算研究体组分的角色,更具体地,不同体扩散速率如何影响极化响应。我们发现体组分确为决定表面极化响应的关键因素。此外,对某些几何,正是体组分的空间异质性触发了极化响应,而这在约化模型中不可能发生。理解极化如何依赖于体扩散率,对研究迁移细胞模型可能至关重要,后者自然受制于区域变形。

关键词

引用

@article{arxiv.2210.13972,
  title  = {Numerical investigations of the bulk-surface wave pinning model},
  author = {Davide Cusseddu and Anotida Madzvamuse},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2210.13972},
  year   = {2022}
}

备注

28 pages (last 2 for SM) with 11 figures (2 in the SM)