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用于多序列比对的时间扭曲神经网络

机器学习 2020-06-30 v1 机器学习

摘要

多序列比对(MSA)是时间序列分析中的一项传统且具挑战性的任务。MSA问题被表述为离散优化问题,通常借助动态规划求解。然而,计算复杂度随输入序列数量呈指数增长。本文提出神经时间扭曲(NTW),将原始MSA松弛为连续优化并用神经网络求得比对。在温和条件下,NTW所得解保证是原始离散优化问题的一个可行解。实验结果表明,NTW成功比对上百条时间序列,并显著优于现有MSA求解方法。此外,我们展示了一种作为NTW应用之一的平均时间序列数据获取方法。与现有重心相比,均值时间序列数据保留了输入时间序列数据的特征。

关键词

引用

@article{arxiv.2006.15753,
  title  = {Neural Time Warping For Multiple Sequence Alignment},
  author = {Keisuke Kawano and Takuro Kutsuna and Satoshi Koide},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2006.15753},
  year   = {2020}
}

备注

11 pages, 5figures, ICASSP 2020