脂肪酶催化赖氨酸酰化选择性的分子规则
定量方法
2019-05-22 v1 化学物理
生物大分子
摘要
结合实验与理论方法，研究了南极假丝酵母脂肪酶B（CALB）催化月桂酸对L-赖氨酸的酰化选择性。实验显示赖氨酸-氨基几乎被专一酰化；仅短暂观察到由赖氨酸-氨基酰化产生的痕量产物。为理解选择性的分子规则，进行了分子建模模拟。柔性对接模拟结合对赖氨酸/CALB结合模式的结构研究，同样提示赖氨酸-氨基的优先酰化，但并未排除赖氨酸-氨基的酰化。为理解两个赖氨酸氨基的区分，计算了赖氨酸与覆盖催化空腔的残基之间的静电相互作用能。结果表明羧酸根基团的邻近阻碍了底物以能够实现N-酰化的构型结合。识别了与覆盖催化三联体的极性区域的关键相互作用，并提出了选择性的合理解释。
引用
@article{arxiv.1905.08518,
title = {Molecular rules for selectivity in lipase-catalysed acylation of lysine},
author = {L. Dettori and Christian Jelsch and Y. Guiavarc'h and S. Delaunay and X. Framboisier and I. Chevalot and C. Humeau},
journal= {arXiv preprint arXiv:1905.08518},
year = {2019}
}