分子胶质稳定水中介氢键在三元复合物中的作用
生物大分子
2025-11-03 v1
摘要
通过稳定弱且瞬时性的蛋白-蛋白相互作用 (PPI)，分子胶质解决了难以靶向的蛋白质问题。Rapamycin 和 WDB002 是两种分子胶质，分别结合 FK506-binding protein (FKBP12)，并靶向 FKBP12-rapamycin 相关蛋白 (FRAP) 和细胞核蛋白 250 (CEP250)。本文利用分子动力学模拟了解分子胶质对蛋白构象和蛋白-蛋白相互作用的影响。分子胶质调节了蛋白的柔性，导致某些区域的柔性降低，并改变了蛋白之间水中介氢键的模式和稳定性。我们的发现突显了在分子胶质的理性设计策略中考虑水中介氢键的重要性。
引用
@article{arxiv.2510.26806,
title = {Molecular glues stabilize water-mediated hydrogen bonds in ternary complexes},
author = {Apoorva Mathur and Mariona Alegre Canela and Max von Graevenitz and Chiara Gerstner and Ariane Nunes-Alves},
journal= {arXiv preprint arXiv:2510.26806},
year = {2025}
}
备注
8 pages, 4 figures, Supplementary information included