Arg9（九聚精氨酸）与 DOPC/DOPG(4:1) 膜相互作用的分子动力学研究
生物大分子
2020-10-08 v2 软凝聚态物质
生物物理
摘要
众所周知，细胞穿透肽（CPPs）的摄取机制依赖于实验条件，如肽浓度、脂质组成、温度等。在本研究中，我们利用分子动力学（MD）模拟在两种不同温度（T = 310 K 和 T = 288 K）下考察了 Arg9 进入 DOPC/DOPG(4:1) 膜的温度依赖性。尽管由于每种温度仅有一个模拟且两种温度下均无 Arg9 跨膜易位的证据而难以确定温度依赖性，我们的模拟表明以下因素与 Arg9 的穿透密切相关：Arg9 配位的水分子数目、Arg9 与脂质分子间的静电能量。我们还展示了 Arg9 如何改变膜的弯曲刚度，以及 Arg9 间的集体行为如何增强穿透与膜弯曲。我们的分析可适用于任意细胞穿透肽（CPPs），以利用 MD 模拟研究其与各种膜的相互作用。
引用
@article{arxiv.2006.02357,
title = {Molecular dynamics studies of interactions between Arg9(nona-arginine) and a DOPC/DOPG(4:1) membrane},
author = {Seungho Choe},
journal= {arXiv preprint arXiv:2006.02357},
year = {2020}
}
备注
10 pages, 12 figures