关于一种可能的蛋白质简化表示的适用性建模研究

研究表明，用一种可能的五类残基简化表示所约简的序列，其折叠特征与采用天然残基集（20 类或 20 个字母）的原始序列相似。约简序列具有良好的可折叠性，并折叠为其优化原始序列相同的天然结构。天然结构的较大基态能隙显示了约简序列的热力学稳定性。通过约简序列与原始序列间的相关性进一步研究了此种五字母约简的普遍适用性。作为比较，发现两类字母的约简因其同聚体特征而不能重现原始序列的天然结构。